质谱成像数据分析软件 - ImageEreveal MS

质谱成像数据分析软件 -  ImageEreveal MS

质谱成像(MSI)硬件的进步使用户能够推动像素分辨率的限制,同时保持短获取时间。这些进步的一个直接结果是数据文件尺寸的指数增加和所执行的实验数量,驱动有必要强大的图像分析软件。欧宝娱乐去哪里下载Shimadzu的ImageEreveal是一个强大的软件,专为处理MSI文件而设计,从而实现了大型数据集的无缝分析。该软件提供了定性和定量解释MSI数据文件所需的所有工具。

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工作流程

分析参数可容易更改,以获得最佳数据处理输出

特征

1.处理只需3步即可

集体分析模式

使用具有预设参数的“集体分析”模式自动获得具有独特特征的MS图像。
这一非常方便的功能允许您将类似的处理参数应用于一组数据文件。从差分分析和/或图像分析中创建数据矩阵表,执行统计数据分析,并在一步中获取MS图像。

传统的分析工作流程与集体分析的工作流程

使用真实数据集的示例

将使用真实数据集显示软件的每个功能。所选数据集是与非酒精脂肪肝炎(纳什)有关的研究的一部分。

什么是纳什?

纳什(非酒精脂肪肝炎)是指与酒精消耗无关的脂肪肝疾病。

用纳什切割小鼠的小鼠序列部分,从串行部分创建染色图像,MS成像数据是从串行部分获得的

使用“集体分析”模式,纳什组织显示相对于正常组织的特性的MS图像被自动选择。

要分析和自动选择的MS图像部分

2.多分析模式

选择Analysis Settings使用多达五种预设方法。可以使用多种方法处理单个数据文件。优化后选择给定数据集的最佳方法。

  1. 发现组织独特的分子(差分分析)
  2. 发现具有与染色图像相同分布的分子(图像分析)
  3. 创建MS图像显示目标分子的浓度分布(定量分析)

使用真实数据集的示例

发现纳什组织独特的分子(差分分析)

可以使用统计分析找到每种类型组织(NASH与正常)的每个兴趣区域之间的独特特征。

获得MS图像,其中纳什组织和正常组织显示不同的分布

找到与染色图像分布相似的分子(图像分析)

ImageEredVeal包括强大的统计工具,使用户能够识别具有独特分布的分子。

类似的图像提取是搜索MS图像数据的方法,并找到显示与彩色图像类似的分布的MS图像

可以使用“图像分类”,“分段”等来执行进一步的数据分析。

创建显示目标分子浓度分布的MS图像(定量分析)

使用校准曲线,将目标分子(ROI)中的靶分子强度转换为浓度值。

获得MS图像显示到达肝脏的药物量

3.使用IMDX转换器支持的所有MSI文件格式OB欧宝2021足球欧洲杯买球平台

使用包含的“IMDX Converter”工具将数据文件转换为可读的IMDX格式。
可以使用此工具转换IMSCope“KBD”格式和一般“分析7.5”和“IMZML”。

1)获取数据2)转换为通用格式3)转换为imdx格式

4.其他特征

目标分析/非目标分析

  • 有针对性的分析:审查特异性,靶向,分子,m / z的热图。
  • 非目标分析:审查指定质量范围的M / Z。

复合清单

访问摘要表列出所有检测到的离子特性:质量到充电比,复合名称和加合物。

结果基于复合清单

同时处理多MS图像数据文件

ImageEreveal用户可以使用相同的处理和分析方法同时处理多个成像和非映像文件。数据分析可以在最多几百GB上进行,而不会分配数据。

仅供研究使用。不用于诊断过程。

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